دراسة القرابة الوراثية بين عزلات محلية من البكتريا المسببة لمرض سل الزيتون

الملخص

يعدّ مرض سل الزيتون الذي تسببه البكتيريا Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi
(Pss) من الأمراض الهامة التي تصيب شجرة الزيتون في سورية. طُبقت تقانات البصمة الوراثية repetitive- PCR (rep-PCR) على 25 عزلة من Pss (تم عزلها وتعريفها بالاختبارات الكيميائية والعدوى الاصطناعية) بهدف تمييز العزلات ورسم شجرة القرابة الوراثية. أظهرت نتائج الرحلان الكهربائي لتقانات rep-PCR وجود حزم مميزة تراوحت أوزانها بين 100bp و 1400bp (24 و12 و12 حزمة لتقانات ERIC-, REP-, BOX-PCR). حُسبت مصفوفة التشابه لنتائج البصمة الوراثية باستخدام برنامج POPGENE 1.32، حيث تراوحت نسبة التشابه في العزلات البكتيرية المدروسة بين 40% و100%. كانت العزلة sav21 المأخوذة من منطقة مصياف هي الأقرب للعزلة المرجعية B46 بنسبة تشابه 85% تليها sav5.2 و sav10.a المأخوذتان من منطقة اللاذقية بنسبة تشابه 80%. انقسمت شجرة القرابة الوراثية إلى عنقودين أحدهما ضم العزلات المرجعية S32،B34،A77،B46 والأخر انقسم إلى تحت عنقودين منفصلين حيث ضم تحت العنقود الأول عزلات منطقة مصياف (sav20،sav21،sav23) وضم تحت العنقود الثاني عزلات محافظة اللاذقية. وبالتالي تمكنت تقانات البصمة الوراثية من تصنيف عزلات Pss إلى ثلاثة عناقيد تبعاً منطقة العزل.